- 平成28年度 春季リーグ 入替戦
| 試合日 | 球場 | 試合 | 対戦カード | 結果 |
| 5月25日(水) | 上柚木公園野球場 | 一回戦 | 帝京大学 ─ 東洋大学 | 0－2 |
| 5月26日(木) | 上柚木公園野球場 | 二回戦 | 東洋大学 ─ 帝京大学 | 0－1 |
| 5月28日(土) | 八王子市民球場 | 三回戦 | 帝京大学 ─ 東洋大学 | 3－6 |
- ※ 帝京大学２部降格、東洋大学１部昇格
| 試合日 | 球場 | 試合 | 対戦カード | 結果 |
| 5月25日(水) | 上柚木公園野球場 | 一回戦 | 國學院大學 ─ 上智大学 | 3－5 |
| 5月28日(土) | 八王子市民球場 | 二回戦 | 上智大学 ─ 國學院大學 | 1－6 |
| 6月7日(火) | 朝霞市営球場 | 三回戦 | 國學院大學 ─ 上智大学 | 5－3 |
- ※ 國學院大學２部残留、上智大学３部残留
| 試合日 | 球場 | 試合 | 対戦カード | 結果 |
| 6月12日(日) | 東京農大グランド | 一回戦 | 城西大学 ─ 東京農業大学 | 3－2 |
| 6月24日(金) | ふじみ野市運動公園野球場 | 二回戦 | 東京農業大学 ─ 城西大学 | 6－6 (延長14回引分) |
| 6月30日(木) | ふじみ野市運動公園野球場 | 三回戦 | 城西大学 ─ 東京農業大学 | 13－5 |
- ※ 城西大学３部残留、東京農業大学４部残留
| 試合日 | 球場 | 試合 | 対戦カード | 結果 |
| 6月18日(土) | 東京理科大グランド | 一回戦 | 東京理科大学 ─ 一橋大学 | 2－6 |
- ※ 東京理科大学５部降格、一橋大学４部昇格
| 試合日 | 球場 | 試合 | 対戦カード | 結果 |
| 8月７日(日) | 東京工業大グランド | 一回戦 | 東京薬科大学 ─ 千葉経済大学 | 4－18 |
- ※ 東京薬科大学６部降格、千葉経済大学５部昇格
